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El grupo de investigación Tecnología del Medio Ambiente viene trabajando en la degradación anaerobia de residuos de alta carga orgánica desde los años 80 aproximadamente. Así, se ha estudiado la degradación anaerobia en una sola etapa, en condiciones tanto mesofílicas como termofílicas, y la degradación anaerobia en fases separadas. Desde el punto de vista del tipo de estudios realizados se incluyen la utilización de diferentes tecnologías anaerobias (reactores de tipo tanque agitado, filtros anaerobios y lechos fluidizados anaerobios), la caracterización cinética de los procesos y su caracterización microbiológica (técnicas de recuento y cuantificación de los microorganismos, incluyendo técnicas moleculares, y test de actividad. Desde entonces se han realizado numerosas tesis de licenciatura y doctorales, proyectos y contratos de investigación tanto públicos (a nivel autonómico, estatal y europeo) como privados que en los últimos años (periodo 2000-2005) han supuesto más de 1,1 M € de financiación con la correspondiente transferencia de tecnología y conocimiento.

Desde el punto de los residuos sometidos al tratamiento anaerobio, se ha aplicado a vinazas de vino, aguas aceitosas procedentes del procesado y mecanizado de piezas metálicas (taladrinas), lodos aerobios de estaciones depuradoras de aguas residuales urbanas que cuentan con el sistema de fangos activos y la fracción orgánica de residuos sólidos urbanos (FORSU).
En la actualidad el grupo cuenta con 34 titulados superiores, de ellos 2 catedráticos, 9 titulares de Universidad y 25 Doctores que constituyen un capital humano altamente cualificado y especializado.

Sus infraestructuras engloban 10 laboratorios de investigación distribuidos en 3 centros de investigación sitos en Puerto Real (Cádiz) y diversas dependencias de docencia y gestión; así como un amplio y versátil equipamiento instrumental analítico (cromatografía líquida y gaseosa, analizador de Carbono orgánico total, microscopios de epifluorescencia, electroforesis capilar entre otros). También se cuentan con 4 plantas piloto de tratamiento biológico de residuos de diferentes capacidades de tratamiento.

El grupo de UCA es el responsable de las actividades relativas a la armonización de metodologías dentro del subproyecto 2 "Producción".